“Exploring Structural Requirements for Sigma-1 Receptor Linear Ligands: Experimental and Computational Approaches”
Il recettore Sigma-1 (S1R) è una proteina coinvolta in una vasta gamma di funzioni biologiche, grazie alla sua capacità di interagire con diversi canali ionici e altre proteine cellulari. Per ottimizzare la ricerca di molecole capaci di legarsi a questo target, è stata applicata una procedura computazionale a più stadi, sviluppando un modello farmacoforico avanzato basato su simulazioni di dinamica molecolare.
Rispetto ai modelli precedenti, la nuova mappa tridimensionale integra caratteristiche idrofobiche aggiuntive e definisce con maggiore precisione le distanze tra gli elementi chiave del legame, aumentando notevolmente la selettività del sistema. Dopo aver superato i test di validazione teorica, l’efficacia del modello è stata verificata sperimentalmente in laboratorio attraverso la sintesi e il saggio di affinità di una nuova serie di composti.
Tra questi, il ligando più attivo ha mostrato un’affinità di legame estremamente elevata, quasi sovrapponibile a quella dell’aloperidolo, utilizzato come farmaco di riferimento.
J Chem Inf Model. 2024 Jun 24;64(14):5701-5711. doi: 10.1021/acs.jcim.4c00500